ANOVA noto anche come Analysis of Variance
è un potente metodo statistico per testare un’ipotesi che coinvolge più di due gruppi (noti anche come trattamenti). Tuttavia, ANOVA è limitata nel fornire approfondimenti dettagliati tra diversi trattamenti o gruppi, ed è qui che,Tukey (T) test
noto anche come T-test entra in gioco. In questo tutorial, vi mostrerò come preparareinput
file ed eseguire ANOVA e Tukey test nel software R., Per informazioni dettagliate su ANOVA e R, si prega di leggere questo articolo a questo link.
Fase 1.0 Scaricare e installare il software R e R studio
- Scaricare e installare l’ultima versione del software R da questo link
- Scaricare e installare R studio da questo link
- Infine, installare la libreria qtl in R
Fase 1.,2 – l’Installazione la directory di lavoro seguendo la procedura riportata di seguito:
Creare un file di input, come illustrato nell’esempio riportato di seguito:
Fase 2: Eseguire ANOVA in R
2.,1 di Importazione pacchetto R
Installare il pacchetto R agricolae
e aprire la libreria digitando il seguente comando:
library(agricolae)
Nota: Si prega di ricordarsi di installare il corretto pacchetto R per l’ANOVA!
2.2 Importazione di dati
Importare i dati digitando il seguente comando:
data= read.table(file = "fileName.txt", header = T)
2.3 Controllo dati
una Volta importati i dati, controllare digitando il seguente linea di comando:
head(data_pressure)tail(data_pressure)
2.,4 ANOVA Condotta
Ora, Basta eseguire ANOVA
digitando il seguente comando righe:
data.lm <- lm(data$Dependent_variable ~ data$Treatment, data = data)data.av <- aov(data.lm)summary(data.av)
I risultati dovrebbero essere simili, come indicato di seguito:
Dalla sintesi di uscita, si può interpretare che c’è una differenza significativa (cioè P < 0.001) tra i tag Treatments
tuttavia, ci perfom di Tukey Test per indagare le differenze tra tutti treaments utilizzando la procedura riportata di seguito.
3.,0 Conduci Tukey test
Digita sotto i comandi per eseguire Tukey test:
data.test <- TukeyHSD(data.av)data.test
Di seguito è riportato il riepilogo del test Tukey:
Dal test T di cui sopra, si può concludere che esiste una differenza significativa nella maggior parte dei gruppi, ad eccezione dei gruppi”6e90dc0874″>
0.,001
Finally, one can plot the above results using the below command:
plot(data.test)
Output: