Istnieje jednak wiele rodzajów tych komórek i nie wszystkie są jednakowo podatne na zakażenie wirusem HIV. Ale jakie dokładnie typy komórek są najbardziej narażone na zakażenie?
zespół naukowców z Gladstone Institutes i University of California, San Francisco (UCSF) stworzył „Atlas komórkowy”, aby odpowiedzieć na to pytanie. Są pierwszą grupą, która globalnie analizuje różne typy limfocytów T CD4+, które HIV wchodzi i manipuluje.,
„za pomocą potężnych nowych technologii, zidentyfikowaliśmy, które komórki HIV lubi wchodzić i zarażać, i jak wirus jest w stanie zmienić komórki raz w nich,” wyjaśnił Nadia R. Roan, PhD, główny autor badania opublikowanego w Cell Reports i badacz wizytujący w Gladstone. „Zmiany wprowadzone w komórkach przez wirusa mogą ułatwić HIV utrzymywać się w organizmie.”
we współpracy ze Stanford, University of Southern California (USC) i University of Alabama (UAB), zespół wykorzystał eksperymentalne, statystyczne i wizualizacyjne podejścia do tworzenia atlasu.,
głównym narzędziem, którego używali, jest CyTOF, który polega na spektrometrii mas do pomiaru wielu parametrów poszczególnych komórek. Ta technologia o wysokiej rozdzielczości przewyższa inne powszechnie stosowane techniki, które ograniczają liczbę parametrów, które można wykryć w tym samym czasie.
„dzięki technologii CyTOF wkraczamy w erę” rozpoznawania twarzy „dla poszczególnych komórek”, powiedziała Marielle Cavrois, pierwsza autorka badania, starszy pracownik naukowy w Gladstone 's Flow Cytometry core i adiunkt w Katedrze Medycyny na UCSF., „Dzięki naszym narzędziom komputerowym możemy teraz użyć tego rozpoznawania twarzy, aby określić, jak wyglądała komórka, zanim HIV nią manipulował.”
biorąc pod uwagę, że HIV radykalnie zmienia zakażoną komórkę, trudno jest prześledzić zakażoną komórkę z powrotem do jej początkowej postaci. Dzięki CyTOF naukowcy byli w stanie badać zainfekowane komórki tak szczegółowo, że mogli monitorować, w jaki sposób wirus HIV je przebudował.,
„porównując komórki, które są podatne na wejście HIV do tych podatnych na zakażenie HIV, dokonaliśmy zaskakującego odkrycia”, dodał Roan, który jest również adiunktem w Katedrze Urologii na UCSF. „Odkryliśmy, że HIV bardzo skutecznie wchodzi do określonego typu limfocytów T CD4+, ale nie jest w stanie namnożyć się w tych komórkach.”
ten efekt może być spowodowany tym, że HIV nie może dalej rozwijać się w tych komórkach lub dlatego, że wirus pozostaje w nich milczący (lub utajony). Tak czy inaczej, ten podzbiór limfocytów T CD4+ może stać się celem zwalczania wirusa.,
„interesujące będzie rozróżnienie, co dzieje się w tych komórkach, w których HIV wchodzi skutecznie, ale nie produkuje wirusa”, powiedział Warner C. Greene, starszy badacz i dyrektor Gladstone Institute Of Virology and Immunology, który jest również jednym z starszych autorów badania. „Jeśli rzeczywiście wirus tworzy utajoną infekcję w tych komórkach, zidentyfikujemy cenny biomarker, który może prowadzić do nowych terapii.,”
inni autorzy tego artykułu zasobów obejmują Nandhini Raman w Gladstone; Rajaa Hussien, Brandon Aguilar Rodriguez, Joshua Vasquez, Matthew H. Spitzer i Joseph M. McCune w UCSF; Trambak Banerjee i Gourab Mukherjee w USC; Nicole H. Lazarus, Eugene C. Butcher, Ann M. Arvin, i Nandini Sen w Stanford; i Jennifer J. Jones i Christina Ochsenbauer w UAB w Birmingham. Prace te były wspierane przez National Institutes of Health (R01AI127219, DP1DA036502) i amfAR Institute for HIV Cure Research.