większość ludzi, którzy mają zdrowy układ odpornościowy, wyzdrowieje bez leczenia. Biegunka może być zarządzany przez picie dużej ilości płynów, aby zapobiec odwodnieniu. Ludzie, którzy są w złym stanie zdrowia lub którzy mają osłabiony układ odpornościowy są na większe ryzyko cięższej i długotrwałej choroby. Małe dzieci i kobiety w ciąży mogą być bardziej podatne na odwodnienie wynikające z biegunki i powinny pić dużo płynów podczas choroby. Szybka utrata płynów z biegunki może być szczególnie zagrażające życiu dzieci., Dlatego rodzice powinni porozmawiać ze swoimi świadczeniodawcami o opcjach płynnej terapii zastępczej dla niemowląt.
leki przeciwbiegunkowe mogą spowolnić biegunkę, ale przed zażyciem takiego leku należy skonsultować się z lekarzem. Nitazoksanid został zatwierdzony przez FDA do leczenia biegunki spowodowanej przez Cryptosporidium u osób ze zdrowym układem odpornościowym i jest dostępny na receptę. Jednak skuteczność nitazoksanidu u osób z immunosupresją jest niejasna.,
osoby zakażone HIV, które podejrzewają kryptosporidiozę, powinny skontaktować się ze swoim lekarzem. W przypadku osób z HIV / AIDS, terapia przeciwretrowirusowa, która poprawia stan immunologiczny, zmniejszy lub wyeliminuje objawy kryptosporidiozy. Jednak nawet jeśli objawy znikną, kryptosporidioza często nie jest uleczalna i objawy mogą powrócić, jeśli pogorszy się stan odpornościowy.