urodzony w Cleveland w stanie Ohio William Masters był synem Francisa Wynna Mastersa i Estabrooksa Taylora Mastersa. Był jednym z dwojga dzieci z młodszym bratem Frankiem. Dorastając, Masters miał szczególnie ciężkie dzieciństwo z rąk ojca. Franciszek był trudnym człowiekiem, który lubił mieć kontrolę i miał bardzo zły temperament. Wszystkie decyzje domowe musiały być przez niego oczyszczone i w napadach gniewu bił Billa pasem, czasami aż wykrwawił się. Mimo to, Bill był bystrym dzieckiem i wyróżniał się w szkole., Po tym, jak jego ciotka Sally zdecydowała się zapłacić czesne, uczęszczał do szkoły przygotowawczej dla chłopców zwanej Lawrenceville School. Gdy Bill rozpoczął edukację, ojciec mistrza uważał go za dorosłego i nie dawał mu żadnego wsparcia finansowego czy rodzinnego. Rzadko odwiedzał Dom. Po ukończeniu wczesnej edukacji uczęszczał i ukończył Hamilton College. Następnie podjął studia medyczne na University of Rochester Medical School, na których uzyskał dyplom lekarza. Był członkiem Alpha Delta Phi i został wykładowcą na Washington University w St. Louis., W 1942 poślubił swoją pierwszą żonę, Elizabeth Ellis, która była znana jako Libby lub Betty. Para miała dwoje dzieci