Sfântul Ioan O ‘ Sullivan a fost însărcinat cu misiunea în 1910, moment în care comunitatea sa a fost împrăștiată și clădirile sale în ruine. El a început să reconstruiască comunitatea parohială, precum și restaurarea vechilor facilități. Misiunea a primit statutul parohial complet în 1918 ca Biserica Misiunii San Juan Capistrano. Capela Serra, cea mai veche clădire biserică în picioare în California și singura clădire existentă în cazul în care St., Junipero Serra este cunoscut a fi spus în masă, a fost folosit pentru servicii, ca Biserica de piatră originală a misiunii a fost distrusă într-un cutremur 1812.de-a lungul anilor s-au făcut diverse eforturi pentru restaurarea bisericii, dar au cauzat numai pagube suplimentare. O ‘ Sullivan, care va servi ca pastor până la moartea sa în 1933, s-a gândit să construiască o nouă biserică parohială modelată pe vechea biserică de piatră, dar nu și-a dat seama niciodată de ideea sa. Cazul modern pentru o nouă biserică parohială a fost preluat de PR. Paul Martin, care a fost numit pastor în 1976., În acest timp, populația catolică din zonă a crescut considerabil, iar Capela Serra era inadecvată nevoilor parohiei.
turnul Cu clopot în amurg
de strângere de Fonduri a început prin 1981, cuprinzând angajamentul de unități și donații de la misiunea de vizitatori. Prima masă din noua clădire a fost oferită de Crăciun 1984, dar construcția nu va fi finalizată timp de încă doi ani., Prima liturghie din noua biserică a fost sărbătorită la 23 octombrie 1986, iar clădirea a fost dedicată oficial de Cardinalul Timotei Manning la 8 februarie 1987.