pacea a fost de scurtă durată, cu toate acestea, de la sfârșitul anului 1798 o nouă coaliție îndreptată împotriva Franței s-a format (Războiul de-a Doua Coaliții, 1798-1802). De data aceasta Prusia a rămas neutră. Frederic Wilhelm al III-lea, un conducător conștiincios și modest, dar ineficient, a fost notabil pentru moralitatea privată, mai degrabă decât pentru priceperea politică. Guvernul de la Berlin a derapat înainte și înapoi, ocupându-se de reforme economice și administrative minore, fără a îmbunătăți semnificativ structura statului., Un deceniu de neutralitate a fost distrus în timp ce comandanții armatei s-au odihnit pe laurii lui Frederic cel Mare. Austria, pe de altă parte, a jucat același rol principal în Războiul celei de-a Doua Coaliții pe care a făcut-o în Războiul primei coaliții, cu același rezultat nefericit. Francezii victorii la Marengo (14 iunie 1800) și Hohenlinden (3 decembrie, 1800) forțat Împăratul Francisc al II-lea să accepte Tratatul de la Luneville (9 februarie 1801), care a confirmat cedarea Renania., Mai mult decât atât, acei conducători care și-au pierdut posesiunile pe malul stâng în condițiile păcii urmau să primească compensații în altă parte a Imperiului. Pentru a realiza această redistribuire a teritoriului, dieta imperială a încredințat un comitet de prinți, Reichsdeputația, cu sarcina de a desena o nouă hartă a Germaniei. Cu toate acestea, Franța a exercitat influența majoră asupra deliberărilor sale. Napoleon a decis să utilizeze soluționarea revendicărilor teritoriale pentru a modifica fundamental structura Sfântului Imperiu Roman., Rezultatul a fost că pauza finală (Hauptschluss) a Reichsdeputația din februarie 1803 a marcat sfârșitul vechii ordini în Germania. În încercarea lor de a stabili un lanț de state satelit la est de Rin, diplomații francezi au adus eliminarea celor mai mici și mai puțin viabile dintre componentele politice ale Germaniei. Prin urmare, ei au promovat, de asemenea, procesul de consolidare națională, deoarece fragmentarea autorității civice în imperiu a fost un element principal al particularismului. Că Napoleon nu intenționa să încurajeze unitatea între vecinii săi, de la sine înțeles., Totuși, el involuntar a pregătit calea pentru un proces de centralizare în Germania care au ajutat pentru a zădărnici planurile sale pentru viitor mărire de Franța.principalele victime ale vacanței finale au fost orașele libere, Cavalerii imperiali și teritoriile ecleziastice. Au căzut cu zecile. Prea slabi pentru a fi aliați utili ai lui Napoleon, au fost distruși de ambiția cuceritorilor lor francezi și de lăcomia vecinilor lor germani., Ei încă se puteau lăuda cu istoria lor antică ca membri suverani ai Sfântului Imperiu Roman, dar existența lor continuă devenise incompatibilă cu guvernarea efectivă din Germania. Moștenitorii principali ai exploatațiilor lor au fost Statele secundare mai mari. Pentru a fi sigur, Napoleon nu a putut împiedica Austria și Prusia să facă unele câștiguri în lupta generală pentru teritoriul pe care l-au ajutat să facă posibil. Dar el a lucrat pentru a aggrandize acei conducători germani, majoritatea din sud, care erau suficient de puternici pentru a fi vasali valoroși, dar nu suficient de puternici pentru a fi potențiale amenințări., Bavaria, Württemberg, Baden, Hesse-Darmstadt și Nassau au fost marii câștigători ai competiției pentru pradă care a fost principalul obiect al negocierilor. Strategia lui Napoleon a fost în tradiția clasică a diplomației franceze, tradiția lui Richelieu și Mazarin. Prinții au fost puși împotriva împăratului pentru a spori rolul pe care Parisul l-ar putea juca în afacerile statelor germane. Cu toate acestea, prinții germani nu s-au supărat că au fost folosiți ca pioni într-un joc politic pentru a promova interesele unei puteri străine., Orice obiecții au ridicat împotriva soluționării din 1803 s-au bazat pe oportunitate și oportunism. Cea mai gravă acuzație a vechii ordini a fost că, în ceasul prăbușirii sale iminente, niciunul dintre conducători nu a încercat să o apere în numele bunăstării generale a Germaniei.adâncitura finală a fost următorul la ultimul act din căderea Sfântului Imperiu Roman. Sfârșitul a venit trei ani mai târziu. În 1805 Austria s-a alăturat celei de-a Treia Coaliții a Marilor Puteri hotărâte să reducă preponderența Franței (rezultând Războiul celei de-a Treia Coaliții, 1805-07)., Rezultatul acestui război a fost chiar mai dezastruos decât cel al războaielor primei și celei de-a Doua Coaliții. Napoleon a forțat principala armată Habsburgică din Germania să se predea la Ulm( 17 octombrie 1805); apoi a coborât la Viena, ocupând mândra capitală a inamicului său; și în cele din urmă a provocat o înfrângere zdrobitoare (2 decembrie 1805) armatelor combinate ruse și austriece la Austerlitz în Moravia (acum în Republica Cehă)., Înainte de sfârșitul anului, Francisc al II-lea a fost forțat să semneze Tratatul umilitor de la Pressburg (26 decembrie), care a pus capăt rolului dominant pe care dinastia sa l-a jucat în afacerile Germaniei. El a trebuit să-și predea posesiunile din Germania de Vest Württemberg și Baden, iar provincia Tirol în Bavaria. Strategia lui Napoleon de a juca Princiar împotriva ambițiilor Imperiale sa dovedit a fi un succes strălucit. Conducătorii statelor secundare din sud l-au sprijinit în războiul împotriva Austriei, iar în pacea care a urmat au fost răsplătiți din belșug., Nu numai că au participat la Prada confiscată de la Habsburgi, dar li s-a permis și să absoarbă orașele libere rămase, Principatele mici și teritoriile ecleziastice. În cele din urmă, afirmând drepturile de suveranitate deplină, conducătorii Bavariei și Württemberg și-au asumat titlul de rege, în timp ce conducătorii Baden și Hesse-Darmstadt s-au mulțumit cu rangul mai modest de mare duce., Ultimele vestigii ale Constituției Imperiale fuseseră acum distruse, iar Germania era pregătită pentru o nouă formă de organizare politică care să reflecte relațiile de putere create de forța armelor.în vara anului 1806, 16 State secundare, încurajate și încurajate de Paris, au anunțat că formează o asociație separată care să fie cunoscută sub numele de Confederația Rinului., Arhiepiscopul Karl Theodor von Dalberg urma să prezideze noua Uniune ca „prinț primat”, în timp ce viitoarele deliberări dintre membri urmau să înființeze un colegiu al regilor și un colegiu al prinților ca organe legislative comune. S-a vorbit chiar despre un „statut fundamental” care ar servi drept Constituție a unei Germanii întinerite. Cu toate acestea, toate aceste planuri curajoase nu au fost niciodată mai mult decât o fațadă pentru realitatea dură a hegemoniei extraterestre din Germania., Napoleon a fost proclamat „protector” al Confederației Rinului, iar o alianță permanentă între statele membre și Imperiul francez i-a obligat pe cei dintâi să mențină forțe militare substanțiale în scopul apărării reciproce. Nu există nici o îndoială ale căror interese ar servi aceste trupe. Conducătorii secundari ai Germaniei trebuiau să plătească un tribut frumos Parisului pentru suveranitatea lor falsă recent dobândită., La 1 August, Statele Confederate și-au proclamat secesiunea din imperiu, iar o săptămână mai târziu, la 6 August 1806, Francisc al II-lea a anunțat că va depune coroana imperială. Astfel, Sfântul Imperiu Roman s-a încheiat oficial după o istorie de o mie de ani.
