Agamemnon shromáždil neochotné řecké síly k plavbě do Tróje. Příprava na odjezd z Aulidě, přístav v Boeotia, Agamemnon armády vzniklé hněvu bohyně Artemis. Existuje několik důvodů v celém mýtu pro takový hněv: ve hře Aeschylus Agamemnon, Artemis se zlobí na mladé muže, kteří zemřou v Troy, zatímco v Sophocles ‚Electra, Agamemnon zabil zvíře posvátné Artemis, a následně se chlubil, že byl Artemis‘ rovný v lovu., Neštěstí, včetně moru a nedostatku větru, zabránily armádě v plavbě. Nakonec prorok Calchas oznámil, že hněv bohyně může být podporován pouze obětí agamemnonovy dcery Iphigenia.,
Achillova kapitulaci Briseis Agamemnonovi, od Domu Tragického Básníka v Pompejích, fresco, 1. století našeho letopočtu, nyní v Neapol Národní Archeologické Muzeum
Klasická dramatizace liší v tom, jak ochotni buď otec nebo dceru, je to osud; některé jsou takové triky, jako prohlašovat, že ona byla vdaná Achilles, ale Agamemnon se nakonec obětovat Ifigenii. Její smrt uklidnila Artemise a řecká armáda se vydala do Tróje., V řecké mytologii bylo představeno několik alternativ k lidské oběti. Jiné zdroje, jako je Iphigenia v Aulis, říkají, že Agamemnon byl připraven zabít svou dceru, ale že Artemis přijal jelena na jejím místě a odvedl ji do Taurisu na krymském poloostrově. Hesiod řekla, že se stala bohyní Hecate.
Agamemnon byl vrchním velitelem Řeků během Trojské války. Během bojů Agamemnon podle jednoho zdroje zabil Antifuse a dalších patnáct trojských vojáků., Ale v Iliadě sám, že je prokázáno, že jatečná stovky více v Knize 11 během jeho aristea volně přeloženo „den slávy“, který je nejvíce podobný Achilles‘ aristea v Knize 21 (oba jsou v porovnání s lions a destruktivní požáry v bitvě, jejich ruce jsou popsány jako „potřísněné s gore“ a „invincible“ Trojské koně uprchnout do zdi, oba jsou apeloval, aby jeden z jejich obětí, jsou oba vyhnout tím, že Hector, oba dostanou zraněn na paži nebo ruku, a oba zabít toho, kdo raněných)., Ještě před jeho aristea, Agamemnon byl považován za jeden ze tří nejlepších bojovníků na řecké straně za prokázané, když Hector výzvy jakéhokoliv šampiona, řecké straně, aby s ním bojoval v Knize 7, a Agamemnon (spolu s Diomedes a Ajax Větší) je jeden ze tří nejvíce si přál, aby tvář mu z devíti nejsilnějších řeckých bojovníků, kteří se dobrovolně přihlásili. A poté, co se smířili, dokonce Achilles v knize 23 připouští, že Agamemnon je “ nejlepší v síle a v házení oštěpu.,“Toto tvrzení je dále dokazuje fakt, že Agamemnon byl jen hlavní bojovník na obou stranách nikdy potřebovat bohů přímou intervenci ke zvýšení jeho sílu, nebo mu dát nějaké nespravedlivé výhody v boji a ještě pořád způsobil neuvěřitelné ničení téměř na stupnici Achilles.
Iliad vypráví příběh o hádce mezi Agamemnonem a Achillem v posledním roce války. Po jednom z nájezdů Achaean armády, Chryseis, Dcera Chryses, jeden z Apollo kněží, byl vzat jako válečná cena Agamemnon., Chryses prosil Agamemnona, aby osvobodil svou dceru, ale setkal se s malým úspěchem. Chryses pak se modlil, aby se Apollo za bezpečný návrat své dcery, která Apollo reagoval na rozpoutání mor přes Achaean Armády. Po učení se od Proroka Calchas, že epidemie by mohla být rozptýlena po návratu Chryseis jejího otce Agamemnona neochotně souhlasil (ale nejdřív nadával Calchas pro dříve nutit Agamemnón obětovat svou dceru Ifigenii) a vydal jeho cenu. Nicméně, jako náhrada za jeho ztracenou cenu, Agamemnon požadoval novou cenu., Ukradl atraktivní otroka jménem Briseis, jednu z válečných kořistí, od Achilles.
V reakci na zbavení Briseis se Achilles stáhl z bitvy a vystavil řecké armády riziku ztráty války. Agamemnon, když si uvědomil, Achilles je význam vítězství ve válce proti Trojan Armády, poslal velvyslanci prosí Achilles vrátit, nabízí mu bohatství, a ruku jeho dcery, ale Achilles odmítl, jen pobídl zpět do akce, když Patroclus byl zabit v bitvě Hectorem, nejstarším synem Krále Priama a Královna Hecuba.,
přestože Agamemnon nebyl roven Achillesovi v statečnosti, byl zástupcem „královské autority“. Jako vrchní velitel povolal knížata do rady a vedl armádu v bitvě. Jeho hlavní vina byla jeho ohromující povýšenost; příliš vznešený názor na jeho postavení, který ho vedl k urážce Chryses a Achilles, čímž přinesl Řekům velkou katastrofu.
po zachycení Troy, Cassandra, odsouzená prorokyně a dcera priamu, padla na agamemnonovu šarži v distribuci válečných cen.