Autoimunitní encefalitida (AE) může produkovat velmi širokou škálu neuro-psychiatrické příznaky. Hlavní výzvou v diagnostice je, že různé příznaky se mohou objevit v různých časech a různých úrovních intenzity, takže onemocnění může napodobovat mnoho dalších poruch. Někteří pacienti zpočátku mají neurologické nebo psychiatrické příznaky, což dále komplikuje diagnózu.,i>
i když jen jeden z těchto příznaků, neznamená, autoimunitní encefalitidy, jinak nevysvětlitelná směs z výše uvedených neuro-psychiatrické příznaky mohou být vodítko, že základní příčinou je autoimunitní encefalitidy.,