Evropě
velké pronásledování Mennonité a další Novokřtěnců v 16. století nuceni jedna skupina Mennonité emigrovat z Nizozemska do Visly oblasti v čem je nyní severní Polsko, kde jejich společenství vzkvétalo. Po jejich poslední mučedník zemřel v Nizozemsku v roce 1574, Mennonité konečně našla politická svoboda, a tím 1700 pokřtěn členství v Mennonitské církve v Nizozemsku dosáhl 160,000., Ve věcech víry následovali osvícení, intelektuální hnutí ze 17. a 18. století, které doufalo v lidské zlepšení správným použitím rozumu. Protože mnoho z povolání byly uzavřeny s nimi, Mennonité se obrátil k podnikání, v procesu, stává bohatý a urbanizované. Stali se dobře známými jako umělci, spisovatelé, a patroni sociálních programů. Přes jejich prosperitu v 18.století, 1837 jejich členství kleslo na asi 15,000., Pokles byl výsledkem mnoha faktorů, včetně touhy získat vládní pozice, nezájmu o církev v důsledku rostoucího bohatství a odvolání učení a služeb reformované církve.
Pronásledování pokračoval i ve Švýcarsku v 18. století řídil mnoho Mennonité jižní Německo, Alsasko, Nizozemsko a Spojené Státy. Hlavní rozkolu došlo v 1693-97, když Švýcarská Mennonite starší Jakob Amann, ve snaze zachovat to, co chápal jako biblické disciplíny, opustil hnutí tvoří Amišské církve., Od 17.do 20. století žila většina mennonitů ve Švýcarsku, jižním Německu a Alsasku v polozavřených venkovských komunitách s jednoduchými agrárními ekonomikami. Nábožensky byli ovlivněni Pietismem, původně luteránským hnutím, které zdůrazňovalo osobní náboženské zkušenosti a reformy.
V roce 1788 mnoho Mennonité emigroval z delty Visly do jižních regionech ruské Říše (Ukrajina), kde získali pozemky a utekl brannou povinnost. Do roku 1835 se asi 1600 rodin usadilo v 72 vesnicích a získalo pozemky ve výši asi 500 000 akrů., V roce 1860 prošla malá skupina mennonitů v Rusku náboženským probuzením a požadovala přísnější disciplínu pro členy Církve. Založili Mennonitské Církve Bratrské, jejíž někteří členové opustili Rusko s jinými Mennonité v roce 1870 poté, co ztratili své osvobození od vojenské služby. Mnoho z těchto přistěhovalců se usadilo na středozápadě Spojených států a v Manitobě v Kanadě.
Podle Světové Války tam bylo více než 120.000 Mennonité v Rusku žít v autonomních komunitách, které jsou řízené náboženské, vzdělávací, sociální, hospodářské, a dokonce i politické záležitosti., Všechny tyto komunity byly zničeny během druhé světové války nebo rozpuštěny Sověty brzy po skončení války v roce 1945. Mennonité dnes žijí po celém Rusku až na Dálný východ jako Sibiř, ačkoli mnozí emigrovali z Ruska do Německa.