La defenestración de Praga
en 1608, los príncipes protestantes, liderados por el Elector del Palatinado Federico V, formaron la Unión Evangélica., A su vez, los católicos establecieron la Liga Santa con Maximiliano de Baviera a la cabeza.
en 1609 el emperador Rodolfo II entregó la «carta de Majestad», que garantizaba la libertad de religión en Bohemia. Pero en 1618, como el emperador Mathias no cumplió con el compromiso, los protestantes se rebelaron. La defenestración de Prag fue considerada como el comienzo de la Guerra de los Treinta Años.
En 1624, la guerra se intensificó debido a la intervención de Christian IV, Rey de Dinamarca, que vino al rescate de los Protestantes., Los daneses fueron derrotados en las batallas de Tilly y Wallenstein (Tratado de Lubeck en 1629). Los católicos fueron absolutamente victoriosos y la casa de Habsburgo estaba en su punto más poderoso ; ya gobernaba Austria, Bohemia y Hungría, una parte importante de Italia, España, así como las partes controladas por los españoles de los Países Bajos.
la intervención de Suecia, seguida de la de Francia
los protestantes permanecieron hostiles debido al edicto de restitución de Fernando II (1625), que los obligó a devolver los bienes eclesiásticos que habían confiscado previamente., Gustavo II Adolfo, Rey de Suecia, luterano que recibió ayuda financiera de Richelieu, acudió al rescate de los príncipes protestantes (pero también tenía la vista puesta en el Báltico) : condujo a sus tropas a brillantes victorias contra los Católicos hasta la batalla de Lützen ‘(1632), donde murió.
cuando los ejércitos imperiales se hicieron muy poderosos, Francia (bajo Richelieu) comenzó la guerra contra el Imperio. Los españoles, que se acercaban a París, fueron derrotados por Condé en Rocroi (1643), mientras que Turenne y las tropas suecas invadieron Bohemia y Baviera.,
La Paz fue restaurada por el Tratado de Westfalia en 1648. Las negociaciones comenzaron en Munster (1644): Las Provincias Unidas se oponían a España, y Francia era enemiga del Santo Imperio alemán. Las negociaciones entre Suecia y el Imperio tuvieron lugar en Osnabruck en 1645. La beneficiaria fue Francia, dada la posesión clara de los tres obispados (Metz, Toul, Verdún), que habían sido territorios en fideicomiso desde 1552. Anexó la baja Alsacia y la ciudad de Brisach en Alemania añadida a Pignerol en Piamonte regresó a Francia ya en 1631 después de la guerra de sucesión de Mantua., Los territorios de Suecia se extendieron hasta el Báltico, y Pomerania Occidental también fue anexionada (la parte oriental había sido anexionada por los Brandeburgo). Tanto los Países Bajos como los cantones suizos fueron reconocidos oficialmente como independientes.
La Casa de Habsburgo perdió una gran parte de su antiguo poder y Alemania, habiendo perdido un tercio de su población, estaba financieramente arruinada y en completo desorden político.