flagelos (singular = flagelo) son estructuras largas, como el pelo que se extienden desde la membrana plasmática y se utilizan para mover una célula entera, (por ejemplo, esperma, Euglena). Cuando está presente, la célula tiene solo un flagelo o algunos flagelos. Los procariotas a veces tienen flagelos, pero son estructuralmente muy diferentes de los flagelos eucariotas. Los procariotas pueden tener más de un flagelo. Cumplen la misma función tanto en procariotas como en eucariotas (mover una célula entera).,
Cuando los cilios (singular = cilio) están presentes, sin embargo, son muchos en número y se extienden a lo largo de toda la superficie de la membrana plasmática., Son estructuras cortas, similares a pelos, que se utilizan para mover células enteras (como el paramecio) o mover sustancias a lo largo de la superficie externa de la célula (por ejemplo, los cilios de las células que recubren las trompas de Falopio que mueven el óvulo hacia el útero, o los cilios que recubren las células del tracto respiratorio que mueven las partículas hacia la garganta que el moco ha atrapado). Los cilios no se encuentran en procariotas.
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