La mayoría de las personas que tienen sistemas inmunitarios sanos se recuperarán sin tratamiento. La diarrea se puede controlar bebiendo mucho líquido para prevenir la deshidratación. Las personas que tienen mala salud o que tienen sistemas inmunitarios debilitados tienen un mayor riesgo de enfermedades más graves y prolongadas. Los niños pequeños y las mujeres embarazadas pueden ser más susceptibles a la deshidratación resultante de la diarrea y deben beber muchos líquidos mientras están enfermos. La pérdida rápida de líquidos por diarrea puede ser especialmente peligrosa para la vida de los bebés., Por lo tanto, los padres deben hablar con sus proveedores de atención médica sobre las opciones de terapia de reemplazo de líquidos para los bebés.
Los medicamentos antidiarreicos pueden ayudar a retrasar la diarrea, pero se debe consultar a un proveedor de atención médica antes de tomar dicho medicamento. La nitazoxanida ha sido aprobada por la FDA para el tratamiento de la diarrea causada por Cryptosporidium en personas con sistemas inmunitarios sanos y está disponible con receta médica. Sin embargo, la eficacia de la nitazoxanida en individuos inmunosuprimidos no está clara.,
Las personas VIH positivas que sospechen que tienen criptosporidiosis deben comunicarse con su proveedor de atención médica. Para las personas con VIH / SIDA, la terapia antirretroviral que mejora el estado inmunológico también disminuirá o eliminará los síntomas de criptosporidiosis. Sin embargo, incluso si los síntomas desaparecen, la criptosporidiosis a menudo no es curable y los síntomas pueden regresar si el estado inmunitario empeora.