IMGT luokkaa 20 yhteisen aminohappoja
IMGT ’Fysikaalis-kemialliset’ luokkaa 20 yhteisen aminohappoja
Yksitoista IMGT ’Fysikaalis-kemialliset’ luokkaa 20 yhteisen aminohappoja on määritelty fysikaalis-kemiallisista ominaisuuksista niiden puolella ketjut (Kuva 1) .,
Näitä standardoituja luokkia käytetään IMGT® – tietokannoissa ja työkaluissa mutaatioiden ja proteiinitekniikan aminohappoluokan muutosten kuvauksessa.
Kuva 1: 11 IMGT ’Fysikaalis-kemialliset’ luokkaa 20 yhteisen aminohappoja .,
’Hydropathy’
| I | V | L | F | C | M | A | W (1) | G | T | S | Y | P | H | N | D | Q | E | K | R |
| 4.5 | 4.2 | 3.8 | 2.8 | 2.5 | 1.9 | 1.8 | -0.,9 | -0.4 | -0.7 | -0.8 | -1.3 | -1.6 | -3.2 | -3.5 | -3.5 | -3.5 | -3.5 | -3.9 | -4.,5 |
| HYDROFOBINEN | NEUTRAALI | HYDROFIILINEN | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Aminohapot ovat tilata kaikkein hydrofobinen yksi, Isoleusiini (I, vasemmalla puolella) kaikkein hydrofiilinen yksi, Arginiini (R, oikealla puolella), mukaan Kyte-Doolitle mittakaavassa .
(1) Tryptofaani, vaikka sen arvo -0,9 vuonna Kyte-Doolittle mittakaavassa, on luokiteltu IMGT ’hydrofobinen-luokan, koska se osallistuu hydrofobinen ydin rakenne-verkkotunnuksia.,
”volyymi”
aminohapot tilataan pienimmästä (G) suurimpaan (W).
”Kemiallista”
”Maksu”
sulfhydryyliryhmän ja cystein ja fenoli-hydroksyyli-ryhmä tyrosiini näyttää jonkin verran pH-riippuvainen ionisaatio.
’Vedyn luovuttaja tai tunnustaja atomit’
On 4 IMGT Vetyä luovuttajan tai vastaanottajan atomit’ luokat. Jokaisen luokan aminohapot ovat taulukon 2 mukaisessa järjestyksessä:
- luovuttaja (R, K, W).
- Acceptor (D, E).
- luovuttaja ja vastaanottaja (N, Q, H, S, T, Y).
- None (A, C, G, I, L, M, F,P, V).,