HIV kohdistuu ensisijaisesti immuunijärjestelmän solutyyppiin, jota kutsutaan CD4 + T-soluksi. Näitä soluja on kuitenkin monenlaisia, eivätkä ne kaikki ole yhtä alttiita HIV-tartunnalle. Mutta minkä tyyppisiä soluja todennäköisimmin tartunnan?
joukkue tutkijat Gladstone Instituutit ja University of California, San Francisco (UCSF) luotu ”cellular atlas” vastata tähän kysymykseen. He ovat ensimmäinen ryhmä, joka analysoi maailmanlaajuisesti erilaisia CD4+ T-soluja, joita HIV tulee ja manipuloi.,
”Käyttämällä tehokkaita uusia teknologioita, voimme tunnistaa, mitkä solut HIV tykkää syöttää ja tartuttaa, ja miten virus voi muuttaa solujen sisällä ne”, selitti Nadia R. Roan, PhD, johtaa tekijän julkaistu tutkimus Cell Raportit ja vieraileva tutkija sijainti Gladstone. ”Viruksen soluihin tekemät muutokset voivat helpottaa HI-viruksen säilymistä elimistössä.”
yhteistyössä Stanfordin, University of Southern California (USC), ja University of Alabama (UAB), joukkue käytetty kokeellinen -, tilasto -, ja visualisointi lähestymistapoja luoda atlas.,
heidän käyttämäänsä päätyökalua kutsutaan Sytofiksi, joka nojaa massaspektrometriaan mittaamaan monia parametreja yksittäisiin soluihin. Tämä korkean resoluution tekniikka ylittää muut yleisesti käytetyt tekniikat, jotka rajoittavat parametrien määrää, joka voidaan havaita kerralla.
”Kanssa CyTOF teknologiaa, olemme siirtymässä aikakauteen ’kasvojen tunnustaminen yksittäisten solujen,” sanoi Marielle Cavrois, ensimmäinen tekijä tutkimuksen, vanhempi henkilökunta tutkija kohteessa Gladstone on virtaussytometria ydin, ja apulaisprofessori sisätautien klo UCSF., ”Tietokoneidemme avulla voimme nyt käyttää tätä kasvojentunnistusta selvittääksemme, miltä solu näytti ennen kuin HIV manipuloi sitä.”
koska HIV muuttaa tartuttamaansa solua dramaattisesti, on vaikea jäljittää infektoitunutta solua takaisin alkuperäiseen muotoonsa. Cytofin avulla tutkijat pystyivät tutkimaan tartunnan saaneita soluja niin yksityiskohtaisesti, että he pystyivät seuraamaan, miten HIV muokkasi niitä.,
”vertaamalla solut, jotka ovat alttiita HIV-merkintä niille alttiimpia HIV-infektio, me tehtiin yllättävä löytö”, lisäsi Roan, joka on myös apulaisprofessori Urologian klo UCSF. ”Huomasimme, että HIV tulee tietyntyyppiseen CD4 + T-soluun erittäin tehokkaasti,mutta ei pysty lisääntymään näissä soluissa.”
Tämä vaikutus voisi olla, koska HIV voi edetä yhtään pidemmälle, ne solut, tai koska virus pysyy hiljaa (tai piilevä) sisällä. Joka tapauksessa tästä CD4+ T-solujen alaryhmästä voi tulla viruksen hävittämisen kohde.,
”Se on mielenkiintoista havaita, mitä tapahtuu näissä soluissa, joissa HIV siirtyy tehokkaasti, mutta ei mennä tuottamaan virus”, sanoi Warner C. Greene, vanhempi tutkija ja johtaja Gladstone Instituutti, Virologian ja Immunologian, joka on myös yksi vanhempi laatijat tutkimuksessa. ”Jos virus todella aiheuttaa piilevän infektion näissä soluissa, olemme tunnistaneet arvokkaan biomarkkerin, joka voi johtaa uusiin hoitomuotoihin.,”
Muut kirjoittajat tämän resurssin artikla sisältää Nandhini Raman klo Gladstone; Rajaa Hussien, Brandon Aguilar Rodriguez, Joshua Vasquez, Matthew H. Spitzer, ja Joseph M. McCune klo UCSF; Trambak Banerjee ja Gourab Mukherjee USC; Nicole H. Lasarus, Eugene C. Teurastaja, Ann M. Arvin, ja Nandini Sen Stanfordin; ja Jennifer J. Jones ja Christina Ochsenbauer at at UAB, Birmingham. Tätä työtä tukivat National Institutes of Health (R01AI127219, DP1DA036502) ja amfAR Institute for HIV Cure Research.