ensimmäinen twenty-yksi Kalifornian tehtäviä, Mission San Diego de Alcala on nimetty 15-luvulla saint, Didacus Alcalá, joka tunnetaan paremmin nimellä St. Diego. Isä Junipero Serran 16. heinäkuuta 1769 perustama espanjalainen uskonnollinen ja poliittinen unelma Alta California mission-ketjun aloittamisesta toteutui.,
alun Perin sijaitsee kukkulalla, josta on näkymät lahdelle, kuivuus vuonna 1774 pakko tehtävän isät liikkua Mission San Diego noin kuusi kilometriä sisämaahan sen nykyinen sijainti, lähellä San Diego River, voit saada enemmän suotuisa maatalouden mailla ja paikallisia Intian kylissä.
syntyperäiset Tipai-Ipai-intiaanit olivat vastustuskykyisiä kolonisaatiolle ja muutamassa viikossa operaation perustamisväkivallan jälkeen sekä intiaanit että lähetyssaarnaajat olivat kuolleet., Vuonna 1775, tyytymättömiä sääntöjä ja määräyksiä, satoja paikallisia Tipai Intiaanit hyökkäsivät tehtävä, aiheuttaa suurta vahinkoa rakennuksessa ja tappaa Isänsä Jayme, jotka olisi tullut Kalifornian ensimmäinen Kristitty Marttyyri. Peläten toinen raid, padres uudelleen tehtävän mukaan tekniset tiedot armeijan fort.
lähetystöväestön kasvaessa myös suuremman kirkon tarve kasvoi. Fransiskaanit palveluksessa master mason Miguel Blanco rakentaa rakennuksen, jolloin suunnittelu pitää vanha muoti jopa aikaan sen loppuun., Kirkon ominaisuuksia silmiinpistävää windows, rakennettu korkeat suojaa intrudres, ja myös estää niitä romahtamassa painon alla adobe seinät. Kun katto halkesi vuonna 1811, operaation etupuolelle lisättiin suuret takapuolet. Lisäys tuli juuri ajoissa – ylimääräinen tuki mahdollisti tehtävän selviämisen vuoden 1812 maanjäristyksestä.
yksi tämän tehtävän silmiinpistävimmistä piirteistä on 46-metrinen pitkä campanario eli bell wall, johon mahtuu viisi kelloa. Suurin näistä pronssi kelloja on nimeltään Mater Dolorosa, ja painaa huikeat 1,200 puntaa., Kaikille lähetysasemille yhteiset kellot palvelivat monenlaisia tarkoituksia: ne ilmoittivat messun, työn, ruokailun ja siestojen ajankohdan. He tietenkin myös varoittivat vaarasta, halusivat kunnioittaa kuolleita, soittivat juhliakseen rauhaa ja julistivat vieraiden saapumista.
Isä Junipero Serran perintö jää tähän eteläiseen valtaosaan Kalifornian edustustehtävistä. Vuonna 1774 rakennettu La Casa de Padre Serra on paikka, jossa mission idealisti aikoinaan nukkui. Huoneen uskotaan olevan ainoa alkuperäinen huone, joka on selvinnyt intiaanien hyökkäyksistä ja luonnonkatastrofeista.
Mission San Diegon sotilasmenneisyys on ollut tapahtumarikas., Yhdysvaltain sotilaallinen miehitys operaatio alkoi vuonna 1846, ja se kesti 16 vuotta, kunnes Presidentti Abraham Lincoln allekirjoitti julistuksen palaamassa tehtävän Katolisen Kirkon vuonna 1862.
Tänään, kirkko ja uudempi kappeli, La Capilla de San Bernardino, yhdistää palvelemaan uskonnollinen keskus Mission San Diego on yhä suuri ja aktiivinen seurakunta.