IMGT classes of the 20 common amino savs
IMGT “fizikai-kémiai” osztályok a 20 közös aminosav
tizenegy IMGT “fizikai-kémiai” osztályok a 20 közös aminosavak határozták meg a fizikai-kémiai tulajdonságai oldalláncok (1 .ábra).,
ezeket a szabványosított osztályokat az IMGT® adatbázisokban és eszközökben használják a mutációk és a fehérjetechnika aminosav osztályváltozásainak leírására.
1 .ábra: a 20 közös aminosav 11 IMGT “fizikai-kémiai” osztálya.,
‘Hydropathy’
| I | V | L | F | C | M | A | W (1) | G | T | S | Y | P | H | N | D | Q | E | K | R |
| 4.5 | 4.2 | 3.8 | 2.8 | 2.5 | 1.9 | 1.8 | -0.,9 | -0.4 | -0.7 | -0.8 | -1.3 | -1.6 | -3.2 | -3.5 | -3.5 | -3.5 | -3.5 | -3.9 | -4.,5 |
| hidrofób | semleges | hidrofil | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
az aminosavakat a legtöbb hidrofób, izoleucin (i, a bal oldalon) a legtöbb hidrofil, arginin (r, a jobb oldalon), a Kyte-doolitle skála szerint .
(1) a triptofán a Kyte-Doolittle-skála -0,9-es értéke ellenére az IMGT “hidrofób” osztályába került, mivel részt vesz a szerkezeti területek hidrofób magjában.,
“térfogat”
az aminosavak a legkisebbtől (G) a legnagyobbig (W) vannak elrendezve.
“Chemical”
“Charge”
a cisztein és a tirozin fenolos hidroxilcsoportjának szulfhidrilcsoportja bizonyos fokú pH-függő ionizációt mutat.
“Hidrogéndonor vagy akceptor atomok”
vannak 4 IMGT “Hidrogéndonor vagy akceptor atomok” osztályok. Az aminosavak minden osztályban a 2. táblázat sorrendjében vannak:
- Donor (R, K, W).
- akceptor (D, E).
- Donor és akceptor (n, Q, H, S, T, Y).
- None (a, C, G, I, L, M, F, P,V).,