de Fleste mennesker som har sunt immunforsvar vil gjenopprette uten behandling. Diaré kan administreres ved å drikke rikelig med væske for å unngå dehydrering. Personer som er i dårlig helse eller som har svekket immunforsvar har høyere risiko for mer alvorlig og langvarig sykdom. Små barn og gravide kvinner kan være mer utsatt for dehydrering som følge av diaré og bør drikke rikelig med væske mens de er syke. Rask tap av væske fra diaré kan være spesielt liv truer med å babyer., Derfor, bør foreldrene snakke med sine helsepersonell om væskeerstatning terapi alternativer for spedbarn.
Anti-diarrheal medisinen kan bidra til å bremse ned diaré, men en lege bør konsulteres før slike medisinen er tatt. Nitazoxanide har vært FDA-godkjent for behandling av diaré forårsaket av Cryptosporidium hos mennesker med sunt immunforsvar og er tilgjengelig på resept. Men, effektiviteten av nitazoxanide i immunsupprimerte individer er uklart.,
HIV-positive personer som mistenker at de har cryptosporidiosis bør ta kontakt med sin lege. For personer med HIV/AIDS, anti-retroviral behandling som forbedrer immunforsvaret status vil også redusere eller eliminere symptomene på cryptosporidiosis. Imidlertid, selv om symptomene forsvinner, cryptosporidiosis er ofte ikke kureres, og symptomene kan komme tilbake hvis immunforsvaret status forverres.