HIV primært mål en type celler i immunsystemet som kalles CD4+ T-celle. Imidlertid, mange typer av disse cellene finnes, og de er ikke alle like mottakelige for smitte av HIV. Men nøyaktig hvilke typer celler som er mest sannsynlig å bli smittet?
Et team av forskere ved Gladstone Institutt og University of California, San Francisco (UCSF) opprettet en «mobil atlas» for å svare på dette spørsmålet. De er den første gruppen til globalt analysere de forskjellige typer av CD4+ T-celler som HIV kommer inn og manipulerer.,
«, Med kraftige nye teknologier, har vi kartlagt hvilke celler HIV liker å gå inn og infisere, og hvordan viruset er i stand til å endre celler inne i dem,» forklarte Nadia R. Roan, PhD, hovedforfatter av studien publisert i Cell Rapporter og besøker etterforsker i Gladstone. «Endringene som er gjort i celler av viruset kan gjøre det enklere for HIV for å vedvare i kroppen.»
I samarbeid med Stanford University of Southern California (USC), og University of Alabama (UAB), teamet brukte eksperimentelle, statistiske og visualisering tilnærminger til å opprette atlas.,
Det viktigste verktøyet de brukte kalles CyTOF, som baserer seg på mass spectrometry å måle mange parametere på individuelle celler. Denne high-resolution-teknologi overgår andre brukte teknikker som begrenser antallet parametre som kan registreres på en gang.
«Med CyTOF teknologi, vi går inn i en epoke av «facial anerkjennelse’ for individuelle celler,» sa Marielle Cavrois, første forfatteren av studien, en ledende ansatte som forsker i Gladstone ‘ s flowcytometri kjerne, og assisterende professor ved Institutt for Medisin ved UCSF., «Med våre dataverktøy, kan vi nå bruke denne ansikts gjenkjenning for å finne ut hva celle så ut før HIV manipulert det.»
Gitt at HIV dramatisk endrer cellen det smitter, det er vanskelig å spore en infisert celle tilbake til sin opprinnelige form. Med CyTOF, forskerne var i stand til å studere infiserte celler i så stor detalj at de kunne overvåke hvordan HIV remodeled dem.,
«Ved å sammenligne de celler som er utsatt for HIV adgang til de som er utsatt for HIV-smitte, og vi gjorde et overraskende funn,» lagt til Roan, som også er assisterende professor i Avdeling for Urologi ved UCSF. «Vi fant at HIV kommer inn i en bestemt type av CD4+ T-celle svært effektivt, men er ikke i stand til å formere seg i disse cellene.»
Denne effekten kan være at HIV ikke kan gå videre i disse cellene, eller fordi viruset forblir taus (eller latente) på innsiden av dem. Uansett, dette delsettet av CD4+ T-celler kan bli et mål for å utrydde viruset.,
«Det vil være interessant å skille mellom det som skjer i disse cellene hvor HIV går effektivt, men ikke gå på å produsere virus,» sa Warner C. Greene, senior forsker og leder av Gladstone Institutt for Virologi og Immunologi, som også er en av de ledende forfatterne av studien. «Hvis faktisk viruset er å etablere en latent infeksjon i disse cellene, vil vi ha identifisert en verdifull biomarkør som kan føre til nye behandlingsformer.,»
Andre forfattere av denne ressursen artikkelen er Nandhini Raman i Gladstone; Rajaa Hussien, Brandon Aguilar Rodriguez, Josva Vasquez, Matteus H. Spitzer, og Joseph M. McCune på UCSF; Trambak Banerjee og Gourab Mukherjee ved USC; Nicole H. Lasarus, Eugene C. Slakter, Ann M. Arvin, og Nandini Sen ved Stanford, og Jennifer J. Jones og Christina Ochsenbauer på UAB i Birmingham. Dette arbeidet ble støttet av National Institutes of Health (R01AI127219, DP1DA036502) og amfAR Institutt for HIV-Kur Forskning.