Kapillærer er de minste blodårene. Veggene består av et enkelt lag av endotelceller og den minste har en enkelt endotelial celle pakket rundt å bli med selv. Disse tillater en enkelt røde blodlegemer til å passere gjennom dem, men bare ved deformerer seg selv. Kapillær endotelceller variere i struktur avhengig av vev skriv der de er funnet. Kontinuerlig kapillærer er de vanligste (dvs.,muskel, fett, nervøs vev) har ingen transcellular perforeringer, og cellene er sammen med stramt nonpermeable veikryss. Fenestrated kapillærer har intracellulære perforeringer kalt fenestrae er funnet i endokrine kjertler, intestinal villi og nyre glomeruli og er mer gjennomtrengelig enn kontinuerlig kapillærer. Usammenhengende kapillærer ha åpne mellomrom mellom endotelceller som er svært gjennomtrengelig, og noen ganger tillater passasje av blod celler mellom dem.Disse er funnet i lever, milt og benmarg., Blodåre endotelceller har membran-bundet vesicular strukturer i sitt cytoplasma. Disse mest sannsynlig transportere store solutes mellom blod til vev mellomrom ved en mekanisme som er fortsatt uklart. En celle-type som delvis omkranser de fleste kapillærer, men som ofte går ubemerket i overføring EMs er pericyte. Dette deler et felles basalmembran med endothelial celler, og sannsynligvis spiller en rolle i kapillær permeabilitet og trykk.