De meeste mensen met een gezond immuunsysteem zullen zonder behandeling herstellen. Diarree kan worden beheerd door het drinken van veel vloeistoffen om uitdroging te voorkomen. Mensen met een slechte gezondheid of met een verzwakt immuunsysteem lopen een hoger risico op een ernstigere en langdurige ziekte. Jonge kinderen en zwangere vrouwen kunnen gevoeliger zijn voor uitdroging als gevolg van diarree en moeten veel vocht drinken terwijl ziek. Snel verlies van vloeistoffen uit diarree kan vooral levensbedreigend zijn voor baby ‘ s., Daarom moeten ouders met hun zorgverleners praten over opties voor vloeistofvervangingstherapie voor zuigelingen.
antidiarreegeneesmiddelen kunnen de diarree helpen vertragen, maar een zorgverlener moet worden geraadpleegd voordat een dergelijk geneesmiddel wordt ingenomen. Nitazoxanide is FDA-goedgekeurd voor behandeling van diarree veroorzaakt door Cryptosporidium in mensen met gezonde immuunsysteem en is beschikbaar op voorschrift. De werkzaamheid van nitazoxanide bij personen met immunosuppressie is echter onduidelijk.,
HIV-positieve personen die vermoeden cryptosporidiose te hebben, dienen contact op te nemen met hun zorgverlener. Voor die personen met HIV / AIDS, zal anti-retroviral therapie die de immune status verbetert ook verminderen of symptomen van cryptosporidiosis elimineren. Echter, zelfs als de symptomen verdwijnen, cryptosporidiose is vaak niet te genezen en de symptomen kunnen terugkeren als de immuunstatus verslechtert.