kapillärer är de minsta av blodkärlen. Deras väggar består av ett enda lager av endotelceller och de minsta har en enda endotelcell lindad runt för att gå med sig själv. Dessa tillåter en enda röd blodkropp att passera genom dem men bara genom att deformera sig själv. Kapillära endotelceller varierar i struktur beroende på vävnadstypen i vilken de finns. Kontinuerliga kapillärer är de vanligaste (dvs,muskel, fett, nervvävnad) har inga transcellulära perforeringar och cellerna förenas av täta icke-permeabla korsningar. Fenestrated kapillärer har intracellulära perforeringar kallas fenestrae finns i endokrina körtlar, tarm villi och njure glomeruli och är mer permeabla än kontinuerliga kapillärer. Diskontinuerliga kapillärer har öppna utrymmen mellan endotelceller är mycket permeabla och ibland tillåta passage av blodkroppar mellan dem.Dessa finns i lever, mjälte och benmärg., Blodkärl endotelceller har membranbundna vesikulära strukturer i cytoplasman. Dessa transporterar troligen stora lösningar mellan blodet till vävnadsutrymmena med en mekanism som fortfarande är oklart. En celltyp som delvis omger de flesta kapillärer men som ofta går obemärkt i överföring EMS är pericyten. Detta delar ett gemensamt basalmembran med endotelcellen och spelar förmodligen en roll i kapillärpermeabilitet och tryck.