HIV riktar sig främst till en typ av cell i immunsystemet som kallas CD4+ T-cellen. Men många typer av dessa celler finns, och de är inte alla lika mottagliga för infektion med HIV. Men exakt vilka typer av celler är mest sannolikt att smittas?
Ett team av forskare vid Gladstone institute och University of California, San Fransisco (UCSF) skapat en ”cellular atlas” för att svara på denna fråga. De är den första gruppen som globalt analyserar de olika typerna av CD4+ T-celler som HIV kommer in i och manipulerar.,
”med hjälp av kraftfull ny teknik identifierade vi vilka celler HIV gillar att komma in och infektera, och hur viruset kan förändra cellerna en gång inuti dem”, förklarade Nadia R. Roan, PhD, huvudförfattare till studien publicerad i CellRapporter och en besökande utredare på Gladstone. ”De förändringar som görs till celler av viruset kan göra det lättare för HIV att kvarstå i kroppen.”
i samarbete med Stanford, University of Southern California (USC) och University of Alabama (UAB) använde laget experimentella, statistiska och visualiseringsmetoder för att skapa atlasen.,
huvudverktyget de använde kallas CyTOF, som bygger på masspektrometri för att mäta många parametrar på enskilda celler. Denna högupplösta teknik överträffar andra vanliga tekniker som begränsar antalet parametrar som kan detekteras på en gång.
”med CyTOF-teknik går vi in i en era av” ansiktsigenkänning ”för enskilda celler”, säger Marielle Cavrois, första författare till studien, en senior staff research scientist i Gladstones flödescytometri kärna och en biträdande professor vid Institutionen för medicin vid UCSF., ”Med våra datorverktyg kan vi nu använda detta ansiktsigenkänning för att bestämma hur cellen såg ut innan HIV manipulerade den.”
med tanke på att HIV dramatiskt förändrar cellen den infekterar, är det svårt att spåra en infekterad cell tillbaka till sin ursprungliga form. Med CyTOF kunde forskarna studera infekterade celler i så stor detalj att de kunde övervaka hur HIV remodeled dem.,
”genom att jämföra de celler som är mottagliga för HIV-inträde till de som är mottagliga för HIV-infektion, gjorde vi en överraskande upptäckt”, tillade Roan, som också är biträdande professor vid Urologiska institutionen vid UCSF. ”Vi fann att HIV går in i en specifik typ av CD4+ T-cell mycket effektivt, men kan inte multiplicera sig i dessa celler.”
denna effekt kan bero på att HIV inte kan utvecklas längre i dessa celler, eller på att viruset förblir tyst (eller latent) inuti dem. Hur som helst kan denna delmängd av CD4 + T-celler bli ett mål för att utrota viruset.,
”det kommer att bli intressant att urskilja vad som händer i dessa celler där HIV går in effektivt men inte fortsätter att producera virus”, säger Warner C. Greene, senior investigator och chef för Gladstone Institute of Virology and Immunology, som också är en av de ledande författarna till studien. ”Om viruset faktiskt etablerar en latent infektion i dessa celler, kommer vi att ha identifierat en värdefull biomarkör som kan leda till nya terapier.,”
Andra författare av denna resurs artikel har Nandhini Raman vid Gladstone; Rajaa Hussien, Brandon Aguilar Rodriguez, Joshua Vasquez, Matthew H. Spitzer, och Joseph M. McCune vid UCSF; Trambak Banerjee och Gourab Mukherjee på USC; Nicole H. Lazarus, Eugene C. Slaktare, Ann M. Arvin, och Nandini Sen på Stanford, och Jennifer J. Jones och Christina Ochsenbauer på UAB i Birmingham. Detta arbete är finansierat av National Institutes of Health (R01AI127219, DP1DA036502) och amfAR-Institutet för HIV Bota Forskning.