HIV er primært rettet mod en type celle i immunsystemet kaldet CD4+ T-cellen. Imidlertid findes mange typer af disse celler, og de er ikke alle lige modtagelige for infektion med HIV. Men præcis hvilke typer celler er mest tilbøjelige til at blive inficeret?
et team af forskere ved Gladstone Institutes og University of California, San Francisco (UCSF) oprettede et “cellulært atlas” for at besvare dette spørgsmål. De er den første gruppe, der globalt analyserer de forskellige typer CD4+ T-celler, som HIV kommer ind og manipulerer.,
“Ved hjælp af kraftfulde nye teknologier identificerede vi, hvilke celler HIV kan lide at komme ind og inficere, og hvordan virussen er i stand til at ændre cellerne en gang inde i dem,” forklarede Nadia R. Roan, ph.d., hovedforfatter af undersøgelsen offentliggjort i Cell Reports og en besøgende efterforsker ved Gladstone. “De ændringer, der er foretaget i celler af virussen, kan gøre det lettere for HIV at fortsætte i kroppen.”
I samarbejde med Stanford, University of Southern California (USC), og University of Alabama (UAB), holdet har benyttet eksperimenterende, statistisk, og visualisering tilgange til at skabe atlas.,
det vigtigste værktøj, de brugte, kaldes CyTOF, som er afhængig af massespektrometri til at måle mange parametre på individuelle celler. Denne højopløsningsteknologi overgår andre almindeligt anvendte teknikker, der begrænser antallet af parametre, der kan detekteres ad gangen.
“Med CyTOF-teknologi går vi ind i en æra med ‘ansigtsgenkendelse’ for individuelle celler,” sagde Marielle Cavrois, første forfatter af undersøgelsen, en seniorforsker i Gladstones Flo .cytometri-kerne og en adjunkt i Institut for medicin ved UCSF., “Med vores computerværktøjer kan vi nu bruge denne ansigtsgenkendelse til at bestemme, hvordan cellen så ud, før HIV manipulerede den.”
i betragtning af at HIV dramatisk ændrer cellen, den inficerer, er det vanskeligt at spore en inficeret celle tilbage til dens oprindelige form. Med CyTOF var forskerne i stand til at studere inficerede celler i så stor detalje, at de kunne overvåge, hvordan HIV ombyggede dem.,
“Ved at sammenligne de celler, der er modtagelige for HIV-indrejse, med dem, der er modtagelige for HIV-infektion, gjorde vi en overraskende opdagelse,” tilføjede Roan, som også er adjunkt i Urologiafdelingen ved UCSF. “Vi fandt, at HIV går ind i en bestemt type CD4+ T-celle meget effektivt, men er ikke i stand til at formere sig i disse celler.”
denne effekt kan skyldes, at HIV ikke kan udvikle sig yderligere i disse celler, eller fordi virussen forbliver tavs (eller latent) inde i dem. På den ene eller anden måde kan denne delmængde af CD4+ T-celler blive et mål for udryddelse af virussen.,
“det vil være interessant at skelne, hvad der sker i disse celler, hvor HIV går effektivt ind, men ikke fortsætter med at producere virus,” sagde seniorarner C. Greene, seniorforsker og direktør for Gladstone Institute Of Virology and Immunology, som også er en af de øverste forfattere af undersøgelsen. “Hvis virussen faktisk etablerer en latent infektion i disse celler, vil vi have identificeret en værdifuld biomarkør, der kan føre til nye terapier.,”
andre forfattere af denne ressource artikel omfatter Nandhini Raman på Gladstone; Rajaa Hussien, Brandon Aguilar Rodrigue., Joshua Vas .ue., Matthe. H. Spit .er, og Joseph M. McCune på UCSF; Trambak Banerjee og Gourab Mukherjee på USC; Nicole H. La .arus, Eugene C. Butcher, Ann M. Arvin, og Nandini Sen på Stanford; og Jennifer J. Jones og Christina Ochsenbauer på UAB i Birmingham. Dette arbejde blev støttet af National Institutes of Health (R01AI127219, DP1DA036502) og amfAR Institut for HIV-Kur Forskning.