IMGT klasser af de 20 almindelige aminosyrer
IMGT ‘fysisk-Kemiske’ klasser af 20 almindelige aminosyrer
Eleven IMGT ‘fysisk-Kemiske’ klasser af 20 almindelige aminosyrer har været defineret af de fysisk-kemiske egenskaber af deres sidekæder (Figur 1) .,
disse standardiserede klasser anvendes i IMGT databases databaser og værktøjer til beskrivelse af ændringer i aminosyreklassen i mutationer og proteinteknik.
Figur 1: de 11 IMGT ‘fysisk-kemiske’ klasser af de 20 almindelige aminosyrer .,
‘Hydropathy’
| I | V | L | F | C | M | A | W (1) | G | T | S | Y | P | H | N | D | Q | E | K | R |
| 4.5 | 4.2 | 3.8 | 2.8 | 2.5 | 1.9 | 1.8 | -0.,9 | -0.4 | -0.7 | -0.8 | -1.3 | -1.6 | -3.2 | -3.5 | -3.5 | -3.5 | -3.5 | -3.9 | -4.,5 |
| hydrofob | NEUTRAL | hydrofil | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
aminosyrer bestilles fra den mest hydrofobe, isoleucin (i, på venstre side) til den mest hydrofile, arginin (R, på højre side), ifølge Kyte-Doolitle skalaen .
(1) Tryptophan er trods sin værdi på -0.9 i Kyte-Doolittle-skalaen klassificeret i imgt ‘hydrofobisk’ klasse, da den deltager i den hydrofobe kerne af de strukturelle domæner.,
‘volumen’
aminosyrer bestilles fra den mindste (g) til den største (.).
‘kemisk’
‘ladning’
sulfhydrylgruppen af cystein og phenolhydro .ylgruppen af tyrosin viser en vis grad af pH-afhængig ionisering.
‘Hydrogendonor eller acceptoratomer’
Der er 4 imgt ‘Hydrogendonor eller acceptoratomer’ klasser. Aminosyrer i hver klasse er i rækkefølge af tabel 2:
- Donor (R, K, Donor).
- Acceptor (D, E).
- Donor og acceptor (N,,, H, S, T, Y).
- ingen (A, C, G, i, L, M, F, P,V).,