Kapillærer er de mindste blodkar. Deres vægge består af et enkelt lag af endotelceller, og de mindste har en enkelt endotelcelle indpakket rundt for at slutte sig til sig selv. Disse tillader en enkelt røde blodlegemer at passere gennem dem, men kun ved at deformere sig selv. Kapillære endotelceller varierer i struktur afhængigt af den vævstype, hvor de findes. Kontinuerlige kapillærer er de mest almindelige (dvs .,muskel, fedt, nervevæv) har ingen transcellulære perforeringer, og cellerne er forbundet med stramme, ikke-permeable kryds. Fenestrerede kapillærer har intracellulære perforeringer kaldet fenestrae findes i endokrine kirtler, intestinale villi og nyreglomeruli og er mere permeable end kontinuerlige kapillærer. Diskontinuerlige kapillærer har åbne rum mellem endotelceller er meget gennemtrængelige og tillader engang passage af blodlegemer mellem dem.Disse findes i leveren, milten og knoglemarven., Blodkarendotelceller har membranbundne vesikulære strukturer i deres cytoplasma. Disse transporterer sandsynligvis store opløste stoffer mellem blodet til vævsrummet ved hjælp af en mekanisme, der stadig er uklar. En celletype, som delvist omkranser de fleste kapillærer, men som ofte går ubemærket i transmission EMs er pericyte. Dette deler en fælles kældermembran med endotelcellen og spiller sandsynligvis en rolle i kapillærpermeabilitet og tryk.