jaká je rodina NF-kB?
u savců se rodina NF-kB skládá z pěti souvisejících transkripčních faktorů: p50, p52, RelA (p65), c-Rel a RelB1,2. Tyto transkripční faktory sdílejí homologii prostřednictvím 300 aminokyselinové N-terminální dna vazebné/dimerizační domény, nazývané rel homology domain (RHD). RHD je platforma, kde členové rodiny mohou tvořit homodimery a heterodimery, což jim umožňuje vázat promotory a zesilující oblasti genů k modulaci jejich exprese.,
RelA, c-Rel a RelB obsahují C-terminální transkripční aktivační domény (TADs), které jim umožňují aktivovat cílovou genovou expresi. V kontrastu, p50 a p52 neobsahují C-terminální TADs; proto, p50 a p52 homodimers potlačit přepis, pokud jsou vázány na protein obsahující TAD, jako je Vztah, c-Rel, nebo RelB nebo Bcl-3 (a související transkripční ko-aktivátor). Na rozdíl od ostatních členů rodiny NF-kB jsou p50 a p52 odvozeny od větších prekurzorů, P105 a p100.
proteiny NF-kB jsou inhibovány proteiny IkB přítomnými v cytoplazmě., V současné době existuje sedm identifikovány IkB členy rodiny: IkBa, IkBß, Bcl-3, IkBe, IkBy a prekurzorových proteinů p100 a p105, které jsou charakterizovány přítomností ankyrin opakuje.
signální dráhy NF-kB
dvě signální dráhy vedou k aktivaci NF-kB: klasické (kanonické) dráhy a alternativní (nekanonické) cesty3-6., Společné regulační krok v obou těchto kaskády je aktivace IkB kinázy (IKK) komplex skládající se z katalytické podjednotky kinázy (IKKa a/nebo IKKß) a regulační non-enzymatické lešení protein NEMO (NF-kB esenciální modulátor také známý jako IKKy).
dimery NF-kB jsou aktivovány fosforylací IkB zprostředkovanou IKK, která spouští degradaci proteazomálního IkB. To umožňuje aktivní podjednotky transkripčního faktoru NF-kB translokovat do jádra a indukovat cílovou genovou expresi., NF-kB aktivace vede k expresi IkBa gen, který funguje jako negativní zpětná vazba smyčky vázat NF-kB podjednotek, ukončení signalizace, pokud přetrvávající aktivace je přítomen signál.